根據基金會中心網的數據，截至2011年，企業及企業家發起的非公募基金會已有285家，占非公募基金會總量的22.3%。這些已有的企業基金會在發展的過程中已經出現了一些問題，主要是因為其資金來源于支持其設立和發展的企業，所以其日常運作絕大多數時候都要唯企業馬首是瞻。

    如何能充分利用企業基金會的資源優勢，使之成為公益慈善領域一支不可忽視的力量？

    第一，企業要明確自己的責任，明明白白將企業和基金會各自的責任義務弄清楚，不要含糊其辭。首先，在發起設立基金會時，企業應確定好基金會的宗旨，需多費一些心思和時間想明白基金會成立以后要做什么，集中關注哪些個領域；其次，在基金會成立初期或發展過程中，企業應出資支持日常運作及在宗旨范圍內開展項目所需要的資金；再者，企業需幫助基金會實現“獨立”：如果企業希望基金會在成立之后，能夠實現資金從企業“斷奶”，就需要企業（家）幫助基金會逐步實現這個目標——在最初的一段時間里，幫助基金會培養專業、獨立的資金運作團隊，逐步實現資金的投資增值。

    第二，厘清與政府的關系。一方面，企業基金會要充分尊重國家的法律法規，在合理合法的范圍之內，盡自己最大的能力，做好自己分內的工作；另一方面，企業基金會的資產不應該被政府用作其社會福利和公共服務的補貼，尤其是他們不能是捐款的直接受益人。如果企業基金會做不到這兩個方面，總是跟政府保持著很曖昧的關系，甚至有很多利益瓜葛和牽扯，那么就很難獨立、健康發展，更別奢望成為卓越、優秀甚至是偉大的基金會。

    第三，建立獨立、務實的理事會?，F在有一些企業基金會的理事會成員，多由企業內部的管理層或來自某些與企業有利益關系的單位的人員擔任。這樣的理事會成員組成至少可能帶來兩個不好的結果：一是非常強勢固執，完全用管理企業的那一套思想來決策，使得執行團隊缺乏應有的靈活性和自主性。另外一個結果則完全相反，理事會形同虛設，完全聽命于企業大老板，沒有獨立的思考和意見。

    因此，企業基金會要獨立運作，就必須建立真正獨立專業的理事會，盡量避免將企業發展過程中的各種利益關系帶到這中間來。理事會成員的構成應該多元化，但有公益慈善背景的成員在數量上必須具有優勢。

    第四，尊重專業?；饡倪\作其實是一項專業性非常強的工作，要保持企業基金會的獨立性，就必須相信并堅持其管理和運作是一項專業性的工作。只有吸引更多、更好的專業人才來參與設計、參與運作，才能使企業基金會的發展具有基金會自身的特點，符合基金會獨有的發展規律。

    企業基金會的發起設立者首先必須意識到要使自己的基金會發展成一個優秀、偉大的基金會，就需要保持其獨立性，而不是企業或企業家的附屬品。